"En ninguna parte alguien concedería que la ciencia y la poesía puedan estar unidas. Se olvidaron que la ciencia surgió de la poesía, y no tuvieron en cuenta que una oscilación del péndulo podría reunirlas beneficiosamente a las dos, a un nivel superior y para ventaja mutua"-Wolfgang Goethe-

miércoles, 20 de septiembre de 2017

Genética y Música

La noche del 29 de septiembre, noche de los investigadores, en la Sala MDD del Centro de Iniciativas Culturales (CICUS), en la Calle Madre de Dios, 1, Sevilla, habrá un concierto peculiar de UNA ORQUESTA EPIGENÉTICA. Este acto me lo ha recomendado un amigo, y está organizada por el CSIC. Os pongo el resumen de la propia organización (Fundación Descubre):

UNA ORQUESTA EPIGENÉTICA es un proyecto educativo que combina ciencia y música. Conoceremos de forma divertida los cambios reversibles en el ADN. La música nos ayudará a entender por qué un ser vivo puede ser un artista: único, irrepetible, moldeado por el ambiente y con capacidad para la innovación. El proyecto se ha desarrollado con alumnos de los Conservatorios Elementales de Música de Mairena del Aljarafe (CEM América Martínez) y Triana (CEM Triana), durante el curso 2016/2017 y cuenta con el apoyo de la Sociedad Europea de Biología Evolutiva
Captura de la web de la Fundación Descubre anunciando la actividad.
Más información en Fundación Descubre

sábado, 9 de septiembre de 2017

Todo lo que brilla no es fluorescente

Todo lo que brilla en la oscuridad no es fluorescente.  Esta entrada la motiva eso precisamente, que para la mayoría de la gente  todo es fluorescente: los muñecos que brillan al apagar la luz, la bolita del pez abisal de Nemo, los collares que reparten en las fiestas de ron o ginebra en las discotecas y por que no, la tónica iluminada por luz azul. Pues cada cosa tiene su nombre.

En general, las sustancias que se iluminan cuando reciben energía se denominan sustancias luminiscentes, con lo cual, lo correcto es hablar inicialmente de luminiscencia. Dentro de la luminiscencia los fenómenos se dividen dependiendo de si la energía que toman las sustancias proviene de una radiación electromagnética, como podría ser la luz UV, lo que se denomina fotoluminiscencia, o de una reacción química, pasando a llamarse quimioluminiscencia.

Dentro de la fotoluminiscencia se puede hacer otra división dependiendo de la naturaleza de su emisión de radiación. Serán sustancias fluorescentes aquellas que una vez reciben energía en forma de radiación,  luz UV generalmente, emiten su propia radiación directamente mediante un mecanismo rápido. El fenómeno cesa en el momento en que se deja de irradiar con luz. Como ejemplo de este fenómeno podemos recordar la tónica, que contiene un compuesto llamado quinina, con propiedades fluorescentes. ¡Por eso te brilla el cubata bajo luz que se usa para ver si el billete es falso!

Ejemplo de fluorescencia. Tónica sin irradiar y tónica irradiada con luz UV. Fotografía de Wikipedia, bajo licencia Creative Commons, autor GeoTrinity

Otro de los fenómenos fotoluminiscentes es la fosforescencia. A diferencia de la fluorescencia no es un fenómeno inmediato, la sustancia es irradiada un tiempo y cuando se deja en oscuridad se observa la emisión de la misma. Sigue brillando hasta que consume la energía, aunque no se esté iluminando en ese momento. Suele necesitar soportes sólidos, porque es un fenómeno muy poco probable y se desestabiliza rápidamente, dejando de emitir. El ejemplo típico es el de las estrellitas que adornan los techos de nuestros hijos, unos piratas fantasma de los click de Playmobil que están muy chulos, las pegatinas de Ulises 31 que regalaban con las bolsas de papas Matutano... ¿os acordais?

Ejemplo de fosforescencia. Fotografías de Ángela Alcázar.
Vamos a hablar ahora de quimioluminiscencia, el fenómeno por el cual una sustancia emite radiación cuando recibe la energía de una reacción química. Es el fenómeno que ocurre cuando flexionas la pulserita o el collar que te dan en la discoteca vas a la fiesta del ron. Otro ejemplo es el de la boyas o los señaladores de cañas de pescar para los que realizan esta actividad de noche. En ambos casos se dobla el contenedor, rompiendo una ampolla interior que mezcla dos líquidos, dando una reacción que emite luz.

Ejemplo de quimioluminiscencia. Fotografías de Ángel Jurado. 
Finalmente vamos a ver un ejemplo especial de quimioluminiscencia al que se denomina bioluminiscencia. Se trata de una reacción quimioluminiscente en un organismo vivo. En realidad, cuando se extraen las sustancias de estos organismos y se usan en un laboratorio también se habla de bioluminiscencia. Se emplea mucho la luciferina de las luciernagas, que se usa en reacciones donde se consume ATP en presencia de luciferasa. Como broma siempre digo a mis alumnos que en una reacción biouminiscente en el laboratorio no se trata de ver si se le enciende el culo a la luciernaga al echarla en un bote, sino de usar los compuestos aislados responsables de la reacción. Más ejemplos se encuentran en medusas, hongos y peces de grandes profundidades.

Ejemplo de bioluminiscencia. Fotografía de Wikipedia bajo licencia Creative Commons. Autor Wofl~commonswiki
Todos estos fenómenos tienen su utilidad en un laboratorio, pero en esta entrada me limito a dar ejemplos cotidianos. Espero haberos aclarado algo y seáis capaces de identificar los distintos casos.

jueves, 24 de agosto de 2017

Linealidad: método del Lack-of-fit

Lo prometido es deuda y he aquí una de las técnicas prometidas en la entrada anterior para el estudio de linealidad. Aunque realmente me gusta dejar claro que esta prueba tiene como cometido principalmente comprobar cuanto error puede aportar a las predicciones la falta de ajuste del modelo. Para hablar de linealidad creo que es preferible comprobar a cada nivel de concentración, porque un modelo que puede parecer globalmente lineal puede no serlo para ciertos niveles de concentración. Pero esa es mi opinión, y por suerte la de muchos.

Debéis disculparme que para esta entrada me ponga en plan técnico más que divulgativo, pero esta entrada tiene fines docentes, y prefiero escribirlo de esta forma.

Partimos de un conjunto de ni puntos de calibración (xi, yi) que presentan una relación lineal aparente, donde se considera que los cada valor de xi está exento de error  y los valores de yi están sujetos a errores de medida pero son homocedásticos. Los valores xi deben aparecer replicados, con lo que estarán agrupados en j (1 a nj) niveles con k (1 a nk) replicados en cada nivel, con lo que ni = nj·nk. Los datos pueden ajustarse a un modelo con c parámetros de ajuste (en regresión lineal c = 2) dando lugar a una ecuación del tipo (1). Siendo y la variable dependiente,  x la variable independiente, b1 la pendiente de la recta de regresión y b0 la ordenada en el origen. La función se obtiene fácilmente mediante el método de mínimos cuadrados minimizando la suma de cuadrados de residuales (2), que considerando la replicación se puede escribir como (3), con grados de libertad  (4).



La prueba  F de falta de ajuste o de Lack-of-fit se basa en un análisis de la varianza (ANOVA) de residuales en el que la suma de residuales, SSE, se descompone en componentes de falta de ajuste. SLF, y error puro SPE, (5) y (6) comprobando la influencia del primero en el error de los residuales. En (7) y (8) se muestra la descomposición de los grados de libertad de cada término.


Los cuadrados medios o varianzas pueden obtenerse fácilmente dividiendo las sumas de cuadrados entre sus correspondientes grados de libertad. De este modo se puede tener la siguiente tabla de ANOVA de falta de ajuste.

Tabla de ANOVA de falta de ajuste (Lack-of-fit)
La prueba de falta de ajuste consiste en calcular un valor F como el cociente entre la varianza (o cuadrado medio) de falta de ajuste y la varianza de error puro.

La hipótesis nula ha de ser entonces que no existe falta de ajuste, el modelo ajusta de forma adecuada a los datos. Si el valor de F calculado es menor que un F tabulado para α = 0.05 (95% de nivel de confianza), nj-c grados de libertad para el numerador y ni-nj grados de libertad para el denominador, se acepta la hipótesis nula. En caso contrario se rechaza y se dice que existe falta de ajuste.

Aunque os parezca tedioso, el cálculo es muy simple y se puede hacer en hoja de cálculo:

1) Obtener SSE a partir de cálculos de regresión o según la fórmula tabla.
2) Obtener SPE según la fórmula de la tabla.
3) Obtener SLF despejando en (5).
4) Dividir entre los grados de libertad indicados en la tabla para obtener MSLF y MSPE.
5) Obtener el F calculado según (9)
6) Comparar con el valor tabulado de F.

Una ventaja de este método es que está implementado en muchos entornos y software como Minitab, R, Statistica, entre otros.

Espero sea de utilidad. Más adelante hablaré del método %RE-plot, propuesto por nosotros, como ya he indicado.

CONTINUARA

miércoles, 9 de agosto de 2017

Lo que hace mi Facultad... Química Verde

La química verde o sostenible tiene en la Universidad de Sevilla unos representantes de referencia. Hablo de los integrantes del grupo de investigación  Organometálicos y Catálisis Homogénea (FQM-223) del Departamento de Química Inorgánica, dirigido por mi compañero y amigo el Catedrático Agustín Galindo del Pozo. Llevan tiempo investigando en el campo de las reacciones de oxidación selectivas catalizadas por compuestos organometálicos utilizando medios de reacción menos contaminantes que los disolventes comunes procedentes del petroleo. Para ello se emplean  líquidos iónicos (ILs), que suelen ser sales de compuestos orgánicos, líquidas a temperatura ambiente, no volátiles y con alta capacidad para disolver  al catalizador. Estos disolventes se pueden reciclar con cierta facilidad, lo que minimiza el impacto del sistema de reacción en el medioambiente. Además se utilizan oxidantes que no dejan restos contaminantes, como el agua oxigenada.

Como se lee en una nota de prensa del Portal de Comunicación de nuestra Universidad, el trabajo de este grupo ha dado lugar a la elaboración de la Tesis Doctoral ‘Procesos de oxidación selectiva catalizados por oxidoperoxidocomplejos de molibdeno usando criterios de química sostenible’, defendida por Carlos Jesús Carrasco, con calificación sobresaliente cum laude. Mi enhorabuena a Carlos, que ha sido un magnifico alumno mío y es una gran persona.

Titular aparecido en le versión digital del diario 20 Minutos en el que se hace eco de la noticia

En el desarrollo de esta tesis han  diseñado y estudiado varios complejos de molibdeno utilizando disolventes (tipo ILs) y reactivos sostenibles y respetuosos con el medioambiente. Como explica Carlos en la nota de prensa; Finalmente, en todos los casos, se han planteado la separación y el reciclado del sistema de reacción, que es una de las condiciones básicas para que un proceso alternativo sea económico y aceptable desde el punto de vista del desarrollo sostenible”. Todo ello ha llevado a la publicación de dos artículos científicos en revistas de reconocido prestigio.  
Resumen del artículo publicado en Catalysis Communications tal y como aparece en la página de la revista 

Enhorabuena grupo, el trabajo bien hecho conlleva su recompensa

Referencias

C. J. Carrasco, F. Montilla, A. Galindo. Molybdenum-catalyzed asymmetric sulfoxidation with hydrogen peroxide and subsequent kinetic resolution, using an imidazolium-based dicarboxylate compound as chiral inductor Catalysis Communications, 2016, 84, 134-136.

C. J. Carrasco, F. Montilla, E. Álvarez, C. Mealli, G. Manca, A. Galindo.  Experimental and theoretical insights into the oxodiperoxomolybdenum-catalysed sulphide oxidation using hydrogen peroxide in ionic liquidsDalton Transactions,  2014, 43, 13711-13730. 

sábado, 5 de agosto de 2017

Sobre linealidad en el rango de calibración analítica

Desde hace unos días he mencionado varias veces un trabajo sobre linealidad en el rango de calibración analítica [1]. Creo que es necesario explicar algunas cuestiones sobre este parámetro de calidad de un método. Una comparación detallada de los distintos métodos para evaluar la linealidad se puede encontrar en un trabajo previo [2] de uno de los autores, Francisco Raposo, y, de hecho, fue el punto de partida para despertar mi interés en este tema. Tengo que agradecer al Dr. Raposo por las discusiones previas que me llevó a plantearme este trabajo y fructificó en una colaboración, por haber insistido en intentarlo en una gran revista como Talanta y por haberse encargado él de la última parte de la revisión (muy luchada) en estos momentos en los que me daba por vencido. El tiempo nos dirá si nuestra propuesta es útil o no.

Cuando somos estudiantes y comenzamos a realizar ajustes lineales en nuestras prácticas de laboratorio nos gusta mucho que el coeficiente de correlación (r) o el de determinación (r^2) sean próximos a la unidad. Si eso es así, nuestra respuesta es lineal... Falso, simplemente si nos aceramos a la unidad podemos asegurar que el modelo empleado para ajustarse a nuestros datos es bueno, pero no que sea el mejor. Este parámetro informa sobre como es de pequeña la suma de cuadrados de residuales, pero no indica como se distribuyen los mismos. Por eso no se recomienda el empleo del coeficiente de correlación o determinación como sinónimo de linealidad. Habría que observar la distribución de los residuales.

Este valor de r^2 puede darse por válido en una práctica, pero sería un error. Si se observa con detalle, los puntos se distribuyen de forma no lineal

Otro parámetro muy usado, que yo he usado mucho para no recurrir al valor de r, es el de linealidad on-line [3], que se calcula como 100 menos la desviación estándar relativa de la pendiente. La desviación estándar de la pendiente aumenta cuando aumenta el error estándar de residuales, con lo que estamos en una caso parecido a hablar de coeficientes de correlación, es decir, te da cuenta del porcentaje de ajuste de acuerdo al error de la pendiente, pero no te dice como se distribuyen los puntos alrededor de la recta de calibración. 

Fórmula de la linealidad on-line

¿Cuál es la solución? Como siempre digo a mis alumnos, lo primero que ha de hacerse cuando se tienen datos en el laboratorio es pintarlos en un papel. Hay que hacer una gráfica, siendo a veces la inspección visual lo que da idea, si los datos se distribuyen bien alrededor de la función ajustada, de si el modelo elegido es el adecuado. Supongamos el modelo lineal, a veces es difícil ver la distribución sobre la misma recta y es preferible usar un gráfico de residuales. Este tipo de gráficos es muy interesante, porque puede indicar que la función elegida no es adecuada simplemente con observar la distribución de los residuales. También puede indicar que la distribución no es homocedástica, lo que implicaría el uso  de un modelo ponderado. Pero si tenemos un gráfico de residuales ¿cómo establecemos el límite que pueda indicar  que un punto está fuera de la tendencia de los demás. Para eso es interesante trabajar con residuos estandarizados. Hay muchas formas de estandarizar, pero nosotros proponemos los residuos Studentizados. Si un residuo supera el valor de 1.96 (aproximamos a 2), se considera que el valor es sospechoso se denomina valor extremo (outlier) si supera el 3. Para aceptar un modelo no debe haber valores sospechosos a lo largo del rango de calibración.

Gráficos de residuales Studentizados correspondiente a la recta anterior. Aunque todos están dentro de los límites se observa una distribución de los mismos que indican la idoneidad de un modelo no lineal

Otra opción es el gráfico de linealidad o de factor de respuesta, que se hizo conocido gracias a Huber [4]. Desde mi punto de vista, este método da cuenta del la variación del factor de respuesta (señal debida al analito dividida entre su cantidad o concentración) a lo largo del rango de calibración, pero poco más. Huber establece unos límites del 5% por encima y por debajo de la mediana de los factores de respuesta y establece la linealidad en el rango en que los puntos se mantienen entre esos límites. Esto funciona generalmente bien en métodos cromatográficos, pero no es así en métodos espectroscópicos. Además no tiene en cuenta que las desviaciones de los factores de respuesta pueden ser muy grandes si trabajamos a concentraciones muy pequeñas. no obstante es un método muy útil para observar cambios en la respuesta del método. 

Se puede observar que el gráfico de factor de respuesta (C) falla en este caso 

El método del lack-of-fit (falta de ajuste)  no lo incluimos en el trabajo. Podéis ver una explicación del mismo en aquellos apuntes de Excel que compartí hace años. Aunque esta entrada en el blog es una declaración de intenciones y quiero trabajar en un par de entradas más sobre linealidad. En la primera describiré exclusivamente el método de lack-of-fit y en la segunda el procedimiento que hemos denominado %RE-plot, el gráfico de errores relativos recalculados.


CONTINUARA...


Referencias

[1] J. M. Jurado, A. Alcázar, R. Muñiz-Valencia, S. G. Ceballos-Magaña, F. Raposo, Some practical considerations for linearity assessment of calibration curves as function of concentration levels according to the fitness-for-purpose approach, Talanta, 2017, 172, 221-229.
[3] L. Cuadros Rodríguez , A. M. García-Campaña , C. Jiménez, M Román, Estimation of performance characteristics of an analytical method using the data set of the calibration experiment, Analytical Letters, 1993, 26,1243-1258.
[4] L. Huber, Validation of analytical methods: review and strategy, LC-GC Europe,1998, 11,  96-105.

martes, 1 de agosto de 2017

Seleccionando datos se construyen teorías

"En el arte de la deducción es fundamental saber discernir, entre diversos datos, cuales son vitales y cuales son accidentales. De lo contrario, la atención y la energía se disipan en lugar de concentrarse."

Esta cita, también extraída del libro de relatos de Sherlock Holmes que ya hemos manejado en varias ocasiones [1], aparece en la historia El misterio de Reigate, inicialmente publicada por Sir Arthur Conan Doyle bajo el título The Adveture of the Reigate Squire en junio de 1893 en la revista The Strand Magazine [2]. Para el que prefiera la cita original: "It is of the highest importance in the art of detection to be able to recognise out of a number of facts which are incidental and which vital. Otherwise your energy and attention must be dissipated instead of being concentrated". Lógicamente nuestro detective se está refiriendo a hechos relacionados con la deducción detectivesca, no a datos numéricos. Pero en la investigación científica también se usa la deducción y todo esto se traslada fácilmente de un campo a otro.

Ilustración, obra de Sidney Paget, de la historia The Adventure of Reigate Squire publicada en The Strand Magazine en junio de 1893.   Imagen de dominio público.

Mi reflexión tras leer la cita es en el fondo algo evidente,  no todo dato científico es, o debe ser, susceptible de ser usado. Todo depende de  la calidad de los mismos, de su forma de obtención, de su carácter peculiar motivado por alguna variable incontrolada o por su propia naturaleza... Y es que hay que tener claro que no todo dato que presente ciertas discrepancias en un entorno científico es debido a su obtención, a veces el dato es el que es. En esta entrada pretendo establecer tres ejemplos que den evidencia de que no todos los datos primarios sirven para establecer modelos o teorías. Y me vais a perdonar que use ejemplos de primera mano, extraídos de  trabajos propios o cercanos. Toda excusa es buena para divulgar la ciencia que se hace en nuestro entorno.

En primer lugar voy a poner un ejemplo muy simple pero muy necesario en el análisis instrumental. Los químicos analíticos preferimos normalmente sistemas de medida en el que una señal producida por una especie química sea linealmente proporcional a su concentración para poder establecer una relación matemática lineal (recta de calibrado) que permita interpolar la señal de una muestra y obtener la concentración de especie en la misma. Es por lo tanto importante que se estudie la linealidad de los datos, es decir, establecer los niveles de concentración en los que la relación señal-cantidad puede considerarse lineal. Recientemente hemos publicado un trabajo [3] en el que se insta a estudiar la linealidad desde un punto de vista práctico. Existen pruebas estadísticas, como el método del lack-of-fit, entre otros, y métodos gráficos, que es por los que nos declinamos. Lo primero es representar los datos y observar su disposición y calidad. A simple vista es posible detectar desviaciones que nos harán acortar el  rango de trabajo. Las tendencias se ven mejor en un gráfico de residuales (preferiblemente estandarizados). También se puede usar un gráfico de factores de respuesta, aunque tiene ciertas limitaciones en técnicas sensibles como las espectroscopias atómicas. Y nuestra propuesta, el gráfico de errores relativos de concentraciones recalculadas. No os asustéis que es muy simple. Se calcula la ecuación de ajuste y se sustituye en la misma la señal correspondiente a cada concentración preparada. Eso da una concentración calculada que difiere más o menos de la preparada. Esa diferencia se divide entre la concentración preparada y se multiplica por cien, considerándose un error relativo. Si todo va bien, estas diferencias relativas no deberían ser superiores al 15%. Nosotros incluimos una función que ajusta este límite dependiendo del rango de concentración en el que trabajemos. Pero en el fondo es muy simple.

Ghraphical abstract del trabajo publicado en la revista Talanta
Con los gráficos propuestos se puede detectar fácilmente los rangos de concentración en los que se puede trabajar considerando respuesta lineal, aumentando así la calidad de las determinaciones. Es decir, hay puntos que se han medido que deben ser eliminados para poder establecer la función de ajuste con una calidad aceptable. Este ejemplo muestra una forma de establecer criterios de aceptación.

En segundo lugar voy a hablar de un ejemplo precioso sobre como la aparición de datos discrepantes (de origen real, no se duda de su medida) pueden enmascarar conclusiones importantes. El trabajo al que me refiero [4] lo realizó el equipo de mi amigo y compañero el Profesor Antonio José Fernandez Espinosa, y versa sobre la identificación de fuentes de contaminación en aguas de lluvia. Se determinan una serie de contaminantes atmosféricos en agua de lluvia, principalmente metales y aniones, que suelen relacionarse con fuentes de contaminación como lluvia ácida, tráfico, combustión industrial, fertilizantes, entre otras. Cuando se parten de los datos en bruto pueden aparecer muestras con valores elevados en algún parámetro, debido principalmente a algún fenómeno puntual. Cuando se crea un sistema que agrupa variables influyentes entre sí, como el análisis de componentes principales (PCA) que proponen los autores, estos datos discrepantes distorsionan los agrupamientos entre variables, haciendo imposible la detección de las fuentes responsables de dichos agrupamientos. Entiéndase que una fuente de contaminación hará aumentar una serie de valores para algunas especies, cuyas concentraciones estarán muy correlacionadas entre si y por eso se agrupan en el PCA. Una muestra de valores anómalos provoca una falsa correlación entre variables y puede confundirse algún agrupamiento. Por lo tanto hay que eliminar ciertas muestras para poder obtener conclusiones. Así, en este trabajo se eliminan los valores anómalos de forma secuencial hasta que queda un modelo donde si es posible detectar fuentes de contaminación.

Captura de una página de la publicación donde se observa la distorsión que pueden ocasionar en la correlación entre variables algunas muestras con valores discrepantes 

El tercer ejemplo se encuentra en un trabajo [5] que realicé en colaboración con mi amigo y paisano el Dr. Francisco Gutiérrez Reguera a partir de los datos de su tesis doctoral. Se trata de un estudio de el origen geográfico de aguas minerales embotelladas. Se dispone de muestras de agua de los sistemas montañosos Cordillera Costero-Catalana, Macizo Galaico, Sistemas Béticos, Sistema Central y Sistema Ibérico. Se analizaron metales, aniones y parámetros como pH,  conductividad y potencial redox entre otros. A partir de estas variables se intentan diferenciar las aguas de acuerdo a  las zonas donde se encuentran  los manantiales. Las muestras de la Cordillera Costero-Catalana son muy diferentes a las demás, y un primer modelo las separa muy bien, dejando al resto de grupos mezclados. Para poder crear un modelo global (que basamos en redes neuronales artificiales, ANN) habría que eliminar esas muestras y crear un submodelo que permita diferenciar los grupos restantes. Ese es el interés de la publicación, la definición de un modelo iterativo en el que una muestra desconocida se introduzca en en un modelo principal. En el caso en que la muestra se clasifique como perteneciente a la Cordillera Costero-Catalana se elimina y no se introduce en el submodelo que permite la clasificación de las cuatro zonas restantes. Para construirlo se debe entonces seleccionar las variables adecuadas para el modelo principal usando todas las muestras de entrenamiento (lo cual hacemos con un análisis discriminante lineal, LDA) y construimos la ANN. El submodelo se crea igualmente seleccionando variables con LDA pero solo con muestras de las cuatro cordilleras restantes. Así, mediante esta selección de datos primarios, se puede llegar a predecir el origen de muestras con un 90% de eficacia.

Captura de la hoja del trabajo en Neural Computing and Applications en la que aparecen el esquema del modelo de clasificación (derecha)
Como conclusión a esta entrada, creo que es necesario decir que, lógicamente no es necesario usar todos los datos primarios para establecer modelos o teorías. Depende de lo que uno busque, se puede seleccionar. Eso sí, hay que revisarlos todos, porque será necesario saber discernir los que tienen utilidad y los que no. Lo importante a la hora de seleccionar bien los datos primarios es hacerlo partir de criterios sólidos, claros y públicos.


Referencias

[1] A. Conan Doyle, El misterio de Reigate. Sherlock Holmes. Relatos 1, PENGUIN CLÁSICOS,  Barcelona, 2016, p. 296. ISBN: 978-84-9105-010-1. (Traducción: Esther Tusquets). 
[2] A. Conan Doyle, The Adventure of the Reigate Squire, The Strand Magazine, June, 1893, pp. 601-613.
[3] J. M. Jurado, A. Alcázar, R. Muñiz, S. G. Ceballos, F. Raposo,  Some practical considerations for linearity assessment of calibration curves as function of concentration levels according to the fitness-for-purpose approach, Talanta, 2017, 172, 221-229.
[4] R. Montoya-Mayor, A. J. Fernandez-Espinosa, M. Ternero-Rodriguez, Assessment of the sequential principal component analysis chemometric tool to identify the soluble atmospheric pollutants in rainwater, Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2011, 399, 6, 2031-2041.
[5] F. Gutiérrez-Reguera, J. M. Jurado, R. Montoya-Mayor, M. Ternero-Rodríguez, Geographical classification of Spanish bottled mineral waters by means of iterative models based on linear discriminant analysis and artificial neural networks, Neural Computing and Applications, 2016. DOI: 10.1007/s00521-016-2459-5


viernes, 9 de junio de 2017

Lo que hace mi Facultad... bioplásticos de soja para añadir nutrientes al campo

Voy a tener que hacer una sección especial para el grupo Tecnología y diseño de productos multicomponentes del Departamento de Ingeniería Química de la Universidad de Sevilla en su línea de trabajo sobre bioplásticos. En esta ocasión, en colaboración con la Universidad de Huelva, se trata de la obtención de un plástico biodegradable a base de proteína de soja que puede absorber casi cuarenta veces su peso en agua, como publica la Fundación Descubre.

Extracto de la noticia en la web de la Fundación Descubre

La soja de por sí misma ya absorbe mucha agua (unas doce veces su peso),  pero los investigadores consiguen aumentar esta propiedad, hasta poder absorber unas 36 veces su peso inicial, aislando la proteína mediante liofilización, modificación de la estructura de la misma y mezcla con un plastificante. Los resultados de la investigación pueden encontrarse en el trabajo publicado en la revsta Polymer Testing bajo el título Natural superabsorbent plastic materials based on a functionalized soy protein.

Lo que me parece interesante es la posible aplicación agrícola. El futuro de este tipo de polímeros pasa por hidratarlos con agua que contenga nutrientes esenciales para el suelo agrícola como sales, hierro y zinc, que una vez añadidos al suelo (con el envase polimérico incluido), vayan liberando estos componentes y los restos de plástico se degraden y sirvan de sustrato. Cuanto menos interesante. 

Aprovecho la ocasión para darle la enhorabuena a los integrantes de este grupo.

miércoles, 31 de mayo de 2017

Acceso libre al Depósito de Investigación de la Universidad de Sevilla

La tesis doctoral era un documento que hace no muchos años quedaba condenado al más profundo y absurdo ostracismo. Es decir, tras escribirla, se la leían tus directores, tu novia, tu primo, cuatro amigos la ojeaban y los que iban a defender la suya después de ti la hojeaban para quedarse con ideas sobre el formato y presentación. Después de eso, se la leían los miembros del tribunal y... ya está. A lo mejor tus padres o hermanos hicieron el paripé cuando les dejaste una copia en el salón. Por suerte hoy día, el formato digital permite distribuir la tesis por todo el mundo, con sus virtudes y defectos. 

¿Por qué hablo de esto? Pues porque no salgo de mi asombro al leer una noticia sobre el mal trago que está pasando un biólogo colombiano porque en su tiempo de estudiante compartió un documento, una tesis de grado sobre  taxonomía de ranas. Se ve que el autor se molestó y lo denunció por violar derechos de autoría. Me asombra que alguien pueda molestarse porque difundan su trabajo, un trabajo que de otra forma quedaría reducido a un circulo muy pequeño de lectores que quizá ni se hayan molestado en buscarle utilidad. No obstante, aviso a navegantes, pedid permiso antes de compartir material no libre que esté por internet, pues la ley es la ley y el autor tiene derecho a demandar. Parece que en este caso, Diego Gómez, el biólogo de la noticia, ha salido absuelto. Pero los fiscales y el autor del trabajo insisten en llevarlo a prisión.

La Universidad de Sevilla hizo algo interesante hace ya mucho tiempo. Todas las tesis doctorales que se defienden de unos años  hacia acá se están publicando en formato digital, obteniendo el autor el ISBN para su obra. Y a los autores de tesis antiguas les solicitaron permiso para poder digitalizarlas. Esa base de datos ha ido creciendo y se ha incorporado al Depósito de Investigación de la Universidad de Sevilla, de acceso libre. 
Logotipo del idUS, Depósito de Investigación de la Universidad de Sevilla
 En este repositorio se pueden incluir tesis doctorales (ahora es requisito obligatorio para su defensa publicarla en abierto), tesis de máster y licenciatura con calificaciones de sobresaliente (a petición del alumno), artículos en revistas en abierto, y pre-impresiones (los llamados preprints) de publicaciones en revistas de régimen no abierto cuyas editoriales permitan esta forma de compartirlos en su página de derechos de Copyright. 

De esta forma, el conocimiento no queda cogiendo polvo en un estante de una biblioteca... hasta que haga falta sitio.

Aquí os dejo la producción del Departamento de Química Analítica

miércoles, 24 de mayo de 2017

Isabel Ovín Camps, Licenciada en Ciencias Químicas

Carmona es una ciudad de la provincia de Sevilla, desde que en el año 1630 le otorgase dicho título el rey Felipe IV, en la que resido actualmente y espero que por mucho tiempo. Ya llevo algunos años en ella y según mis papeles ya soy carmonense. Pues como carmonense y como químico, no quiero dejar pasar este año para hablarles de una ilustre mujer, natural de Carmona, que ejerció su labor como maestra en esta ciudad, Isabel Ovin Camps (1887-1972).  

Isabel Ovín Camps


El primer conocimiento que tuve sobre la figura de esta mujer fue una placa de  azulejos en la calle Santa Lucía. En ella está la sede de la Asociación de Mujeres "Isabel Ovín". Preguntando sobre quien era, me dijeron que una maestra que hubo en el pueblo y de hecho hay una calle Maestra Isabel Ovín Camps muy cerquita de donde vivo ahora. Entre los distintos cometidos de la asociación destaca su implicación por la difusión de la cultura mediante la convocatoria del Concurso Regional de Cuentos y Poesías "Isabel Ovín", que en 2016 contaba con su XXV edición. 

Sede de la asociación Isabel Ovín en calle Santa Lucía, 26A
Tampoco seguí mucho la pista, pues había muchas calles con nombres de maestras del pueblo, pero no sabía que esta iba a ser especial. En el año 2011 se celebraba el Año Internacional de la Química, coincidiendo con el centenario de la concesión del Premio Nobel en Química a  María Sklodowska Curie, y mi compañero, que también fue mi profesor, Fernando Romero Guzmán coordinó una publicación conmemorativa para esa fecha tan importante: 100 Preguntas, 100 Respuestas sobre Química. Entonces me habló, ya que conocía mi relación con Carmona, de Isabel Ovín, la primera mujer Licenciada en Ciencias Químicas de España en el año 1917. Una mención a ella aparece en el documento antes citado, en la pregunta con respuesta número 100 [1]. En junio de 2011,en el número 89 de la revista Químicos del Sur [2], se hace una descripción pormenorizada de cuando hizo su primer matrícula en 1913, culminando sus estudios en 1917. El 30 de julio de este año 2017 se cumplirá un siglo de la obtención de su título y por eso quería hacer este homenaje. 

En ese artículo  se mencionaba que quiso ir a Madrid a  cursar la Cátedra, pero su madre cayó enferma y se quedó en Carmona para cuidarla [2]. Y entonces se dedicó a la docencia. Se hizo maestra y en 1920 estuvo trabajando como profesora de Ciencias fisicoquímicas en el Colegio de Segunda Enseñanza  de Nuestra Señora de Gracia, sito en Carmona [3]. Y según la publicación de Químicos del Sur [2], llegó a dirigir el Instituto Murillo de Sevilla en 1941.

Anuncio aparecido en el diario independiente El Sol, número 859, Madrid, 1920 
Otra curiosidad es su dedicación a la política local, de acuerdo a un artículo aparecido en el diario ABC en mayo de 1979 [4]: "Isabel Ovín Camps fue concejal desde el 13 de mazo del año 1925 hasta el 26 de febrero de 1930, como podrá comprobarse en las actas capitulares de dicho periodo". En ese mismo artículo también se decía: "Isabel Ovín fue, tal vez, la primera licenciada en Ciencias Químicas que hubo en España, aunque dedicó toda su larga vida a la más modesta -y más hermosa- labor de maestra de escuela, como entonces se decía. Somos muchos los que guardamos un hondísimo amor y una gratitud imperecedera a la buena memoria de Isabel, ser excepcional adornada de las mejores prendas morales, y que hasta su muerte fue venerada por toda Carmona". Entre los alumnos destacados que tuvo cuenta el también carmonense, y Premio Principe de Asturias, Manuel Losada Villasante. Que dijo sobre ella que [2]: “sólo puedo decir que, después de dudar de si yo servía para estudiar, me hizo tan atractivas y comprensibles las ciencias, que jamás encontraría después en ellas antipatía ni obstáculo durante mi carrera”. Isabel Ovin recibió por su labor la Cruz de Alfonso X El Sabio en 1954.

El día 11 de mayo de 1972 aparece en el diario ABC una necrológica en la que reza [5]: 

ROGAD A DIOS EN CARIDAD
por el alma de la Iltma. Sra.
DOÑA ISABEL OVIN CAMPS
Licenciada en Ciencias Químicas, maestra nacional y Medalla
 de Alfonso X el Sabio
FALLECIO EN CARMONA EL DIA 10 DE MAYO DE 1972, A LOS OCHEN-
TA Y CINCO AÑOS DE EDAD, DESPUES DE RECIBIR LOS SANTOS SA-
CRAMENTOS Y LA BENDICION DE SU SANTIDAD
R.I.P.A.
El profesorado y alumnado del colegio nacional "Isabel Ovín"

Y sigue informando sobre el sepelio en la Iglesia prioral de Santa María y entierro en el Cementerio de San Teodomiro. Sus restos fueron trasladados al panteón de carmonenses ilustres de dicho cementerio en el año 2014 [6]

Ojalá fuese yo capaz de despertar en mis alumnos  la mitad de admiración que la maestra Dña. Isabel Ovín suscitó entre los suyos. Y hasta aquí mi pequeño homenaje a una mujer, que obviamente no conocí, pero que fue referente en su época y en su localidad, que ahora es la mía.

Referencias

[1] F. Romero (coordinador), 100 Preguntas, 100 Respuestas, Andalucía Innova, Especial Química, Junta de Andalucía, 2011, p. 39.
[2] Isabel Ovin Camps. La primera mujer que estudió y se licenció en Ciencias Químicas en toda España Químicos del Sur. Revista de los químicos de Andalucía y Extremadura, Ilustre Colegio Oficial de Químicos de Sevilla, 2011, 89,.22-23
[3] El Sol, núm. 859, Madrid, 24 de abril de 1920, Suplemento p. 14
[4] ABC, 26 de mayo de 1979, p. 19
[5] ABC, 11 de mayo de 1972, p. 67
[6] ABC, edición digital, 9 de octubre de 2014.

lunes, 22 de mayo de 2017

La verdad absoluta en Ciencia

"Tengo desde hace tiempo como máxima que, una vez has eliminado lo imposible, aquello que queda, por improbable que sea, tiene que ser la verdad"
Volvemos a la carga con otra cita de Sir Arthur Conan Doyle en boca del famoso detective Sherlock Holmes. En este caso la extraigo de la historia La aventura de la diadema de berilos, publicada en el libro de relatos del que ya hablé con anterioridad [1]. Esta historia se publicó en The Strand Magazine [2] en 1892, donde la cita original es "It is an old maxim of mine that when you have excluded the impossible, whatever remains, however improbable, must be the truth". Es decir, una vez eliminado lo imposible lo que queda tiene que ser la verdad, pero al no usar "have to be" sino "must be", implica que lo que se dice es decisión del que habla. Tiene que ser la verdad, porque lo digo yo. De todas formas, antes de imponer su verdad, Holmes indica que hay que eliminar lo imposible. Se atribuye a Lord Kelvin, allá por el 1900, la frase [3]: Ya no hay nada nuevo que descubrir en Física. Todo lo que queda es hacer medidas cada vez más precisas. Poco después la teoría de la relatividad de Einstein y el nacimiento de la Física Cuántica contradijeron a este eminente científico. Por eso no creo en verdades absolutas, hay que ser prudentes. 

Primera página de The adventure of the Beryl Coronet publicada por A. Conan Doyle en 1892 en The Strand Magazine. Ilustración de Sidney Paget. Digitalizado por Google.

Dicho esto, me van a perdonar que use esta cita para dar mi opinión sobre la inexistencia de la verdad absoluta en la ciencia. Verdad a veces impuesta, de forma inconsciente o consciente, por algún autodenominado gurú, o en su creencia, algún capo di tutti li capi. Para ello tendré que hablar desde mi experiencia personal respecto al proceso de publicación de trabajos científicos, citando algunos pecados, que no pecadores. No quiero hablar de la prepotencia de algunas personas en otros foros, porque prefiero dormir tranquilo. A ustedes siempre les queda la opción de contar su propia experiencia o contrarrestar mi opinión en algún comentario a esta entrada, desde el respeto, claro está. Les debe quedar claro que esta es mi opinión y seguramente, desde algún punto de vista, esté equivocado.

Antes de mi experiencia, un repaso a la realidad de científicos que realmente fueron importantes, con los que nunca podré compararme. Qué me dicen de Daniel Shechtman, Nobel de Química en 2011, al que incluso su jefe ridiculizaba por hablar de cuasicristales . O Ignaz Semmelweism, humillado por querer demostrar que un lavado de manos antes de examinar a los pacientes disminuye el riesgo de infección. El suicidio de Ludwig Boltzmann se atribuye a una incomprensión y falta de aceptación de sus ideas. Darwin fue caricaturizado como un mono en la revisa satírica La petite Lune. De hecho, ¿sabéis de quien es la imagen que aparece en la etiqueta del Anís del Mono? Y podríamos buscar más ejemplos de luchas encarnizadas por culpa de la prepotencia de colegas o ideologías.

Etiqueta de Anís del Mono donde aparece un mono con la cara de Darwin


Uno de los comentarios mas hirientes que nos pueden hacer después de meses de trabajo es que lo que se intenta publicar no tiene relevancia científica, novedad o interés. Los editores suelen ser comedidos y automáticos, deben tener un botón en su intranet para enviar un mensaje tipo que dice que reciben muchos trabajos y que tiene que seleccionar solo un porcentaje de los mismos. Y es que las revistas científicas se mueven por modas y novedades, porque es la forma que tienen de alimentar su sistema. En Química Analítica se debe trabajar en metodologías novedosas de preparación de muestra, hibridación instrumental, aplicación de la nanotecnología, contaminantes emergentes, bioanálisis o técnicas "ómicas" (perdonen si olvidé algo). Si sales de ahí, y juegas a estudiar rutinariamente muestras, todo lo metodológico suele estar descrito y te piden que pruebes a publicar en otros campos como la Ciencia y Tecnología de los Alimentos o Ciencias Medioambientales. Pero no crean que eso da opción a publicar de forma sencilla, porque muchas revistas de estas áreas recurren fácilmente a la falta de novedad, dependiendo de la matriz de estudio o de las técnicas de análisis aplicadas. Pero bueno, son las políticas editoriales y debemos adaptarnos, buscando otra revista que nos acepte. En ese sentido tengo anécdotas en las que tuve que ir bajando el nivel (índice de impacto, en el cual no creo) y otras en las que al final el nivel incluso subió.

Lo que me molesta es cuando pasas el filtro del editor y es alguno de los revisores el que ni siquiera te indica algún cambio y despacha el trabajo con un "lack of novelty". Eso es vergonzoso y demuestra mucha falta de profesionalidad y respeto a los demás. Hay otros que se enfadan tanto con tu atrevimiento de enviar un trabajo a determinadas revistas, que deben ser coto privado de caza, que empiezan a listar errores hasta que te entran ganas de dejar el trabajo en un cajón y dedicarte a mirar las perdices por la ventana. No lo hagas.   Posiblemente muchas de sus críticas sean acertadas, pero la verdad en ciencia no es absoluta. Los científicos inamovibles, deben ser vencidos con razones imparables.

Tengo una colección de casos, más de los que aquí cito, que he sufrido en propias carnes. En uno de ellos, por culpa de una crítica feroz, con la recomendación de leerme una serie de trabajos que sospechosamente eran de un mismo autor, sobre la idoneidad de usar el método de mínimos cuadrados parciales (PLS) en vez de redes neuronales para regresión generalizada (GRNN), dejé de intentar publicar en revistas del primer cuartil (Q1) y me dediqué a revistas más modestas pero donde se me trató con mucha educación [4]. Es probable que el revisor tuviese razón, aunque el hecho era que a mi me funcionaban mejor las GRNN, porque en el trabajo las comparaba, y era lo que estaba estudiando en aquellos momentos. No obstante deciros que yo tampoco estoy en posesión de la verdad, los algoritmos neuronales sufren mucho de sobreajuste y con el tiempo aprendí, gracias a una crítica muy constructiva de un revisor a un trabajo posterior, como evitarlo. Desde entonces compruebo todos mis modelos con un procedimiento de remuestreo denominado jackknife [5].

En otra ocasión se me planteó, en una revista  Q1,  que la clasificación de variedades de té a partir del espectro UV-Vis aplicando métodos de reconocimiento de patrones, que vino a costar a mi universidad unos cien euros en reactivos y electricidad, no era interesante porque eso ya lo podía hacer un panel de expertos catadores. Imagino que el revisor se refería a hacerlo en un país de salarios muy bajos. En este caso dejé caer queriendo la publicación en una revista de menos indice de impacto pero gran solera [6], donde se le dio importancia al uso de los espectros UV-Vis y la transformación matemática de los mismos para generar posteriormente modelos de clasificación. Es uno de los trabajos de los que me siento más orgulloso. Después, un autor más listo que yo hizo la extracción de las hojas de té en agua (yo usaba metanol-agua) y publicó algo parecido en la revista que inicialmente rechazó nuestro trabajo. Pero bueno, la verdad absoluta del revisor fue refutada no una, sino dos veces. En muchas ocasiones nos empeñamos en intentar publicar en revistas de alto índice de impacto, cuando por la temática es mejor buscar más abajo en revistas más adecuadas para lo que uno quiere contar. Eso me ha pasado al menos en dos ocasiones más. Reconozcamos que nuestras verdades tampoco son absolutas. Pero te enfadas al ver trabajos similares y posteriores en las mismas revistas que un día te dijeron que no.

A veces, gracias a la obstinación de algún coautor, si hemos vencido. Hace poco enviamos un trabajo a la revista Talanta (Q1), influenciado por un compañero que vio potencial en el trabajo, que versaba sobre procedimientos gráficos (con límites de confianza) de comprobación de la linealidad en la calibración. Resultado, una revisión dura pero salvable y otra demoledora, que me hizo sentir cual hereje. Trabajo no novedoso e inútil, porque ya hay métodos mejores en uso. Yo, que por motivos personales me he retirado temporalmente de mi actividad académica, dejé en manos de mi compañero el trabajo, porque estoy cansado de verdades absolutas y de luchar contra los elementos.  Pero mi compañero escribió al editor de Talanta y le hizo ver las diferencias entre ambas revisiones, demostrando que realmente hay distintas opiniones y que hay que dejar crecer la ciencia. El editor, que es una persona muy correcta, admitió un segundo intento. Parece ser que envió el trabajo a los mismos revisores porque uno de ellos seguía siendo demoledor y el otro estaba algo más convencido tras los cambios. Un tercer revisor desempató y conseguimos publicar el trabajo [7]. Posiblemente este método no sea una solución definitiva, pero es sencillo de usar y entender y tiene en cuenta la aptitud del método analítico para la finalidad del mismo (fitness-for-purpose). Este procedimiento lo explicaré en el blog en otra ocasión.

Imagen del trabajo aceptado en Talanta

Nadie, por muy bueno que sea en su campo, está en posesión de la verdad absoluta. En Quimiometría no hay modelos exentos de error y tal vez por eso me cuesta poco reconocer la relatividad de la verdad. En cuanto a la novedad e importancia de un tema, hay campos de trabajo muy importantes para la sociedad, pero no por ello se debe despreciar otros. Es muy común que la ciencia se mueva en busca de lo novedoso, pero no es acertado dejar parada la investigación básica y los campos más "humildes", porque a veces pueden sorprendernos.

Con esta entrada solo pretendo que, si alguna vez les toca a ustedes revisar una publicación, piensen en el esfuerzo realizado por los autores, consideren puntos de vista distintos a los suyos y hagan críticas constructivas independientemente de si van a aceptarla o no. Tengo desde hace tiempo como máxima que... nunca debes hacer a nadie lo que no te gustaría que te hiciesen a ti. 

Referencias

[1] A. Conan Doyle, La aventura de la diadema de berilos. Sherlock Holmes. Relatos 1, PENGUIN CLÁSICOS,  Barcelona, 2016, p. 296. ISBN: 978-84-9105-010-1. (Traducción: Esther Tusquets).
[2] A. Conan Doyle, The adventure of the Beryl Coronet, The Strand Magazine, January-June, 1892, pp.511-525.
[3] Michael Hanlon, Diez preguntas: Guía para la perplejidad científica, Ediciones Paidos Ibérica, Barcelona, 2008, p.11. ISBN:978-84-493-2166-5. (Traducción: Isabel Febrian, Cristina García).
[4] J. M. Jurado, J. A. Ocaña, Fluorometric Determination of Mixtures of Quinolones by Means of Partial Least Squares and Neural Networks, Analytical Sciences, 2007, 23, 337- 341.
[5] S. G. Ceballos, J. M. Jurado, R. Muñiz, A. Alcázar, F. Pablos, M. J. Martín, Geographical Authentication of Tequila According to its Mineral Content by Means of Support Vector Machines, Food Analytical Methods, 2012, 5260-5265.
[6] A. Palacios, A. Alcázar, F. de Pablos, J. M. Jurado, Differentiation of tea varieties using UV–Vis spectra and pattern recognition techniques, Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy, 2013, 103, 79-83.
[7] J. M. Jurado, A. Alcázar, R. Muñiz, S. G. Ceballos, F. Raposo,  Some practical considerations for linearity assessment of calibration curves as function of concentration levels according to the fitness-for-purpose approach, Talanta, 2017, 172, 221-229



jueves, 18 de mayo de 2017

Lo que hace mi Facultad... una tabla periódica de verdad

Hoy entono el mea culpa  por no haber mencionado nunca con anterioridad la existencia de una tabla periódica con elementos de verdad, en su estado de oxidación 0, que se encuentra en la Facultad de Química de la Universidad de Sevilla. Bueno, realmente hay 83 de los elementos (creo haber contado), pues los radiactivos o extremadamente inestables no están presentes. Para los ausentes se incluyen fotografías. También hay anotaciones sobre sus descubridores, además de la información básica esperable en cualquier tabla periódica.

Imagen de la Tabla Periódica de los Elementos de la Facultad de Química de la Universidad de Sevilla. Fuente: Intranet  de descargas de la facultad
La colección de elementos de esta tabla se reunió por iniciativa de Luis Javier Sánchez Fernández, Investigador del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) adscrito por convenio al Departamento de Química Inorgánica de la Universidad de Sevilla, en cuyo pasillo principal se encuentra esta joya. Entre los donantes hay una lista amplia de profesores de la facultad y algunas empresas. Como la fotografía no tiene buena resolución, os recomiendo que visitéis la página web del Catedrático Agustín Galindo del Pozo, adscrito al mismo departamento. En ella podréis ver fotografías ampliadas de los elementos, en los casos en los que ha sido posible. Por ejemplo, para que no creáis que hay engaño, oxígeno y xenón se ven líquidos tras enfriarlos con nitrógeno líquido. Pero sin duda lo que realmente merece a pena es ir a verla de verdad.

Como curiosidad, ¿Sabéis el descubrimiento de qué elementos se atribuyen a españoles [1, 2]?

El platino se descubrió en 1735 por el matemático Antonio de Ulloa y del Torre Guiral en Perú. Pero fue purificado en 1750 por el físico William Brownrigg.

El vanadio se atribuye al sueco Nils-Gabriel Sefstrom en 1830, quien halló su oxido. Realmente fue un descubrimiento del mineralogista y químico español  Andrés Manuel del Río y Fernández en 1801, llamando al elemento eritronio. Del Río pensó que se había equivocado en su análisis del mineral, suponiendo que lo que contenía era cromo, pero en 1831 Friedrich Wöhler confirmó que en realidad era vanadio. El metal fue aislado por primera vez por el inglés Henry Enfield Roscoe en 1869.

El wolframio fue aislado por primera vez por los hermanos riojanos Fausto y Juan José Elhuyar en 1872 a partir de sales de hierro y manganeso de un ácido, ácido que consiguieron reducir con carburo hasta obtener el elemento. Lo llamaron wolframio en honor al mineral del que lo habían obtenido, la wolframita. Fueron los primeros en publicar el descubrimiento y análisis del elemento. Pero por poco podría haber sido descubierto por el sueco Carl Wilhelm Scheele, que predijo la existencia del elemento en un mineral de calcio, denominada por él mismo Scheelita, que era wolframato de calcio. El  mineral se conocía anteriormente con el nombre de tungstita, de ahí que el elemento se denomine también tungsteno. La IUPAC mantuvo el símbolo W pero el nombre que usa es tungsteno. Yo lo seguiré llamando wolframio, o como se escribiría en el español de aquella época, volframio .


[1] Soledad Esteban, La Historia del Sistema Periódico, Editorial UNED, 2010
[2] Norman E. Holden, History of the Origin of the Chemical Elements and Their Discoverers, Document BNL-NCS-68350-01/10-REV prepared for the 41st IUPAC General assembly, 2001

sábado, 13 de mayo de 2017

Resultados negativos en investigación

"No llores porque el sol se ha ocultado, tus lágrimas te impedirán observar las estrellas"

Hoy propongo pensar sobre esta traducción del sexto verso del libro Los Pájaros Perdidos de Rabindranath Tagore (1861-1941). Tagore fue un poeta y pensador nacido en Calcuta, educado en Inglaterra y laureado con el Premio Nobel de Literatura en 1913. Esta cita es muy conocida en distintas versiones y seguramente alguno de vosotros la haya utilizado en alguna ocasión, porque está grabada en el ADN cultural de muchas generaciones. En mi caso conocí a Tagore por mor de una compañera del taller de teatro al que acudía antes de saber que me dedicaría a la química. Un día, paseando por una feria de Libro Antiguo y de Ocasión de las que me gustan tanto, vi un librito barato [1] (creo que no llegó a 200 pesetas, 1.20 euros de ahora), del cual he tomado prestada esta traducción. Para los que prefieran la cita en inglés [2]: "If you shed tears when you miss the sun, you also miss the stars". Yo quizá hubiese traducido como "Si lloras cuando te pierdes el sol, también te pierdes las estrellas". ¿Pero quien soy yo para traducir poesía? Para eso están personas excepcionales como Zenobia Camprubí Aymar (1887-1956), que tradujo la obra de Tagore mientras su esposo, el poeta andaluz Juan Ramón Jiménez (1881-1958), Premio Nobel de Literatura en 1956, revisaba el sentido poético de los textos. Tengo pendiente buscar la traducción de Zenobia para este verso.


Portada del libro El Jardinero / Los Pájaros Perdidos. Edicomunicación S.A. Diseño de cubierta: Quality Design

Sin más dilación voy a exponer el motivo de recordar este verso en relación al título escogido para la entrada que propongo. Para ello, hablaré primero de un Trabajo Fin de Grado (TFG) en Química Analítica que supervisé en el laboratorio. Después hablaré brevemente, por no tratarse de mi campo de trabajo, de un Trabajo de Fin de Grado de Química Orgánica y un Trabajo Fin de Máster (TFM) de Química Inorgánica en los que fui miembro del tribunal de evaluación.

El primer caso es el de un alumno que decidió proponer y validar un método para la determinación directa de Ca, Fe, Mg y Mn en vinos finos. Buscaba un método verde, minimizando el uso de reactivos, comparando la determinación directa de muestras diluidas con agua con un método de referencia basado en la digestión previa de las muestras con una mezcla de ácido nítrico y peróxido de hidrógeno, midiendo en ambos casos mediante espectroscopia de absorción atómica de llama. Realizó un estudio previo de efecto matriz sobre una muestra seleccionada para decidir que tipo de calibrado debía utilizar. Aplicó el método a una serie de muestras y comparó los resultados entre el método propuesto y el de referencia. Para ello se representan los resultados obtenidos mediante el método propuesto frente a los del método referencia. Debe obtenerse una linea recta de pendiente 1 (ausencia de errores proporcionales) y ordenada en el origen 0 (ausencia de errores constantes). No parecía haber errores proporcionales, es decir diferencias entre los métodos debido al cambio en la concentración en la muestra. Pero había mucha dispersión en los datos en el caso del Mn y Ca y los resultados eran significativamente mayores para el método propuesto (ordenada significativamente distinta de 0) en el caso de Ca y Mg. El alumno no veía el sol después de meses de trabajo. Pero cuando le mencioné casos en los que se debe comparar el efecto matriz en muestras con matrices ligeramente diferentes y concentraciones distintas y la corrección del blanco de Youden, y estudió sobre ello, fue capaz de ver las estrellas. Ya había cumplido sus horas de trabajo experimental y defendió sus resultados negativos alegando que la dispersión se podía deber a diferencias en la naturaleza de las distintas muestras analizadas, que influían en la atomización en la llama, y que los errores constantes podían estar relacionados con la señal esperada para el blanco de Youden. Presentó datos de validación del método clásico y concluyó que debía realizar más estudios sobre la determinación directa. Obtuvo una calificación de sobresaliente.

Gráfico de comparación de métodos en el caso del Ca

Los otros dos casos los resumiré más. Un alumno de TFG trabajaba en métodos para sintetizar norbornenos, estructuras bicíclicas rígidas, mediante reacción de Diels-Alder. El alumno explicó muy bien los mecanismos de reacción y describió sus experimentos, pero parecía triste porque sus rendimientos no llegaban al 60% (creo recordar) en el mejor de los casos. También recuerdo una alumna de TFM que sintetizaba unos catalizadores a base de compuestos organometálicos de cobre y zinc para la oxidación de alcoholes en medios iónicos. Tampoco obtuvo los resultados deseados para el rendimiento de la reacción que pretendía catalizar, después de meses de trabajo. En ambos casos algunos miembros de sendos tribunales nos ensalzamos en hacerles ver la importancia de sus resultados "negativos" y calificamos los trabajos con una nota de sobresaliente.


Actualmente en el ámbito científico la publicación es un objetivo en sí, y en pro de la búsqueda de estabilidad laboral, reconocimiento en el área o la consecución de fondos, entre otros motivos, puede provocar en el científico cierta presión por obtener resultados positivos. Pero soy de la opinión de que los resultados negativos en ciencia tienen muchísimo valor y merecen ser divulgados. El problema está en que nosotros mismos nos empeñamos en publicar solo los resultados positivos y las revistas científicas se han acostumbrado a eso, o viceversa. Los revisores de los artículos tienden a rechazar trabajos que no cumplen las expectativas de partida con mayor frecuencia que aquellos que presentan "buenos resultados". Actuando como revisor en algunas revistas he intentado siempre hacer críticas constructivas a trabajos donde se observaban resultados no muy alentadores, animando a los autores a buscar una explicación a esos presuntos malos resultados. La publicación de nuestros resultados negativos puede influir en que otros investigadores no pierdan su tiempo y recursos intentando caminos ineficaces o sean capaces de ver los errores y dar un giro a la investigación. Estas mismas ideas aparecen en una publicación titulada Negative results are disappearing from most disciplines and countries [3], publicado en la revista Scientometrics en el año 2012. En este trabajo se recalca la pérdida de información valiosa y el sesgo que adquiere la ciencia cuando sólo se publican resultados positivos. Las revistas se acostumbran a recibir y nos acostumbran a enviar solo resultados positivos. Los investigadores se sienten tentados a sobre-interpretar sus conclusiones para que parezcan más importantes de lo que en realidad son o realizar solo investigaciones de poco riesgo que darán lugar a tímidos avances científicos. Y la ciencia solo avanza cuando se asume el riesgo de equivocarse. Y la publicación de resultados negativos, si la fundamentación y explicación de los mismos está bien planteada, son vitales para el desarrollo científico. Esta es precisamente la filosofía de revistas como The All Results Journals, de la que ya hablé con anterioridad, cuyo principal objetivo es la recuperación y publicación de dichos resultados negativos. Aunque navegando por la página web de la misma, no son muchos los autores que se atreven a ello. El motivo, a mi entender, está principalmente relacionado con la fiebre por publicar en revistas con alto índice de impacto, requisito necesario para medrar en el ámbito científico-laboral, propiciado por nuestras instituciones y por nosotros mismos. El que esté libre de pecado...


[1] Rabindranath Tagore. Verso 6, en Los Pájaros Perdidos. El Jardinero-Los Pájaros Perdidos. COLECCIÓN FONTANA Edicomunicación S.A., Barcelona, 1994. ISBN:84-7672-620-1 (Traducción: Jorge Rottner).

[2] Rabindranath Tagore, Stray Birds, Collected Poems and Plays of Rabindranath Tagore, MACMILLAN AND CO., London, 1950.

[3] D. Fanelli, Negative results are disappearing from most disciplines and countries. Scientometrics, 2012, 90, 891-904.